Završni dio takmičenja u Kupu BiH u sezoni 2008/2009, u organizaciji NS/FS BiH, započinje utakmicama 1/16 finala.
Žrijebanje parova 1/16 finala biće izvršeno u četvrtak, 11. 09. 2008. godine, sa početkom u 12:00 sati, u Sarajevu (KSC “Skenderija” – galerija “Colegium artisticum”).
U okviru ove faze takmičenja igra se prema jednostrukom kup-sistemu.
Utakmice 1/16 finala će biti odigrane u srijedu, 24. 09. 2008. godine u 16:00 sati. U slučaju neriješenog ishoda, odmah će biti izvođeni jedanaesterci.



















