Žrijebanje parova šesnaestine finala Kupa BiH u takmičarskoj 2006/2007 godini će biti izvršeno u utorak, 12. 09. 2006. godine, u Sarajevu u 12 sati (KSC „Skenderija“, galerija 'Colegium artisticum').
Prema Propozicijama takmičenja, u završnom dijelu Kupa BiH učestvuje 16 klubova Premijer lige, te 10 klubova iz Nogometnog saveza Federacije BiH i šest klubova iz Fudbalskog saveza Republike Srpske, koji su stekli pravo učešća u šesnaestini finala Kupa BiH putem kup takmičenja u okviru entitetskih saveza.
Pored klubova Premijer lige BiH, u završnom dijelu Kupa BiH učestvuju: NK Zvijezda (Gradačac), NK TOŠK (Tešanj), FK Bosna (Visoko), NK Stanić Kreševo (Kreševo), NK Branitelj (Mostar), FK Mrkaljević (Čelić), NK Odžak 102 (Odžak), NK Tomislav (Tomislavgrad), NK Sloga (Bosanska Krupa-Otoka), FK Goražde (Goražde), FK Rudar (Prijedor), FK Famos (Vojkovići), FK Ljubić (Prnjavor), FK Drina (Zvornik), FK Kozara (Gradiška), FK BSK (Banja Luka).
Utakmice šesnaestine finala Kupa igraju se prema jednostrukom kup-sistemu, a na rasporedu su u srijedu, 20. 09. 2006. godine u 15.30 sati.
| Klub | U | P | N | I | Bod | |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |  HŠK ZRINJSKI |
13 | 11 | 1 | 1 | 34 |
| 2 |  FK BORAC |
12 | 10 | 1 | 1 | 31 |
| 3 |  FK SARAJEVO |
13 | 5 | 5 | 3 | 20 |
| 4 |  NK ŠIROKI BRIJEG |
13 | 4 | 5 | 4 | 17 |
| 5 |  BSK |
13 | 4 | 4 | 5 | 16 |
| 6 |  FK ŽELJEZNIČAR |
13 | 3 | 4 | 6 | 13 |
| 7 |  FK VELEŽ |
12 | 3 | 3 | 6 | 12 |
| 8 |  NK ČELIK |
13 | 2 | 5 | 6 | 11 |
| 9 |  FK RADNIK |
13 | 2 | 5 | 6 | 11 |
| 10 |  FK SLOGA DOBOJ |
13 | 2 | 3 | 8 | 9 |
Ženski fudbal
NFSBIH
TRIBINA