Žrijebanje parova četvrtfinala Kupa BiH u sezoni 2006/2007 će biti izvršeno u prostorijama NS/FS BIH, u petak, 27. 10. 2006. godine, u 12:00 sati.
U četvrtfinale su se plasirali: Borac, Čelik, Modriča Maxima, Sarajevo, Slavija, Široki Brijeg i Željezničar, dok će odluku o osmom učesniku četvrtfinala sutra donijeti Komisija za takmičenje NS/FS BiH, jer je NK „Mrkaljević“ najavio žalbu na utakmicu osmine finala protiv FK „Goražde“, odigranu juče u Čeliću, u kojoj su Goraždani slavili nakon boljeg izvođenja jedanaesteraca.
U četvrtfinalu se igra po dvostrukom kup-sistemu, a susreti su na rasporedu 8. i 22. novembra ove godine.




























